除牙線外，牙簽也是一種常用的自我清潔牙間隙的工具。牙簽能較好地清除牙刷清潔不到的附著於凹面的或根分叉區的食物及導致融齒的菌斑。至於牙齦乳頭萎縮和牙間隙增大的患者，則使用牙線最為合適。
使用牙簽清潔口腔，是人類的一種古老習慣。據《本草綱目》記載,“柳枝去風消腫止痛,其嫩枝削為牙杖,剔齒甚妙。”到了清代，我國出現了飾有各種圖案的金銀牙簽。在日本長野市的牙簽博物館，收集了古今東西方各國的牙簽。
目前使用的牙簽，有木制、橡膠、塑料等多種類型。其中，木制牙簽較為普遍和經濟。無論木制的還是金屬制作的牙簽，其橫斷面應呈扁圓形或三角形，尖頭較細，表面光滑無毛剌，質硬而不易折斷，以減少剔牙時對牙齦的損傷。塑料牙簽為匕首形，尖端和刀口部圓鈍而薄，容易叉進牙間隙，在挑剔嵌塞的食物時，不會損傷牙齦，而且牙簽兩側有細小的凸點，可以柔和地摩擦根面。
在使用牙簽時應注意：將牙簽的頭朝著牙齒的胎面方向，抵在牙齒的頰面上，以45度角滑行到牙縫內，順著牙縫剔，上頜牙齒向下外側剔撥，下頜牙齒向上外側剔撥，如果是纖維性食物嵌塞時，可做頰舌、側穿刺動作來剔除。然後將牙簽的側面貼緊牙面,可做上下和前後兩個方向的摩擦,遂將牙齒的鄰接面和接近牙齦邊緣上的菌斑去淨，同時也將牙面磨光，最後用漱口水或清水含漱，清潔口腔。在使用牙簽時動作一定要輕柔,不可用力過大，以免損傷牙齦。牙簽的尖端不可垂直插入牙間隙中，以免刺傷軟組織,引起局部感染。否則時間長了，牙齦退縮,牙縫越來越大，會加重食物嵌塞。
如果牙簽太粗，或者使用的時候太用力,會使得兩個牙齒之間的牙齦乳頭萎縮，牙齒就漏了風。所以，使用牙簽時一定要注意挑選質量好的。牙簽有足夠的硬度和韌性，就可以避免折斷;表面光滑無毛剌，則可以避免刺傷牙齦。
牙簽對汙物的去除率約為50%左右，效果不如牙線,而且使用不當會損傷牙齦。所以，牙醫不反對剔牙,但也不推薦剔牙。牙醫提倡的是用牙線代替牙簽。用牙線去除牙間食物殘渣和菌斑最有效,而且不會損傷牙齦。
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